盡管馬齒莧的藥用價值很高，是藥食兩用植物，但馬齒莧仍舊有副作用。開始吃馬齒莧的時候一定要少量，得等到逐漸適應了才能多吃。而且馬齒莧里只能放白糖，不能放紅糖。因為紅糖性溫，與治療的方向相背。馬齒莧性涼，脾胃虛弱、大便易瀉以及孕婦忌食。還有，馬齒莧不能與胡椒、該粉、鱉甲一起食用。