先天性心臟病的癥狀表現視乎先天性心臟病的類型和病情復雜程度而言。先天性心臟病根可分為這幾類：

無分流類：左右兩側無分流、無紫紺，如肺動脈口狹窄、主動脈狹窄、主動脈縮窄、原發性肺動脈擴張、原發性肺動脈高壓或右位心等。

左至右分流類：在左右心腔或主肺動脈間有異常通道，左側壓力高于右側，左側動脈血通過異常通道進入右側靜脈血中。

右至左分流類：右心腔或肺動脈內壓力異常增高，血流通過異常通道流入左心腔或主動脈。

輕度先天性心臟病患者沒有明顯的癥狀。如果是嚴重患者活動后會出現呼吸困難、暈厥、紫紺甚至休克的癥狀。另外輕度先天性心臟病患者在兒童時期會經常感冒，容易患有呼吸道感染、支氣管炎、肺炎等，生長發育也會比較差、容易疲憊等。