蛤蜊味咸寒，具有滋陰潤燥、利尿消腫、軟堅散結作用。《本草經疏》中記載，說：“蛤蜊其性滋潤而助津液，故能潤五臟、止消渴，開胃也。咸能入血軟堅，故主婦人血塊及老癖為寒熱也。”現在除這種傳統用法外，還對蛤蜊組織進行化學提取，提取物稱為蛤素。動物實驗證明，蛤蜊對小鼠的肉瘤和腹水瘤都有抑制作用和緩解作用。

現代醫學認為，蛤蜊肉燉熟食用，一日三次可治糖尿病；蛤蜊肉和韭菜經常食用，可治療陰虛所致的口渴、干咳、心煩、手足心熱等癥。常食蛤蜊對甲狀腺腫大、黃疸、小便不暢、腹脹等癥也有療效。

蛤蜊肉以及貝類軟體動物中，含一種具有降低血清膽固醇作用的代爾太7—膽固醇和24—亞甲基膽固醇，它們兼有抑制膽固醇在肝臟合成和加速排泄膽固醇的獨特作用，從而使體內膽固醇下降。它們的功效比常用的降膽固醇的藥物谷固醇更強。人們在食用蛤蜊和貝類食物后，常有一種清爽宜人的感覺，這對解除一些煩惱癥狀無疑是有益的。中醫認為，蛤蜊肉有滋陰明目、軟堅、化痰之功效，有的貝類還有益精潤臟的作用。