首先，要清楚所謂轉(zhuǎn)基因食品就是移動動植物的基因并加以改變，制造出具備新特征的食品種類。而轉(zhuǎn)基因大豆主要是把某些細菌的基因接入大豆的植株中，就可以更好地保護它們不受害蟲的侵襲。因此轉(zhuǎn)基因大豆的制品——轉(zhuǎn)基因大豆油從營養(yǎng)成分含量和組成與非轉(zhuǎn)基因大豆油幾乎沒有差別，也就致使油脂加工企業(yè)在這方面常常不做說明或避而不談轉(zhuǎn)基因大豆油的隱患。其次，要清楚轉(zhuǎn)基因食品的確存在這以下五大隱患：

一是毒性問題。一些研究學(xué)者認(rèn)為，對于基因的人工提煉和添加，可能在達到某些人們想達到的效果的同時，也增加和積聚了食物中原有的微量毒素。

二是過敏反應(yīng)問題。對于一種食物過敏的人有時還會對一種以前他們不過敏的食物產(chǎn)生過敏。

三是是營養(yǎng)問題。科學(xué)家們認(rèn)為外來基因會以一種人們目前還不甚了解的方式破壞食物中的營養(yǎng)成分。

四是對抗生素的抵抗作用。當(dāng)科學(xué)家把一個外來基因加入到植物或細菌中去，這個基因會與別的基因連接在一起。人們在服用了這種改良食物后，食物會在人體內(nèi)將抗藥性基因傳給致病的細菌，使人體產(chǎn)生抗藥性。

五是對環(huán)境的威脅。在許多基因改良品種中包含有從桿菌中提取出來的細菌基因，這種基因會產(chǎn)生一種對昆蟲和害蟲有毒的蛋白質(zhì)，生態(tài)學(xué)家們認(rèn)為那些不在改良范圍之內(nèi)的其它物種有可能成為改良物種的受害者，生物學(xué)家們則擔(dān)心為了培養(yǎng)一些更具優(yōu)良特性，其特性很可能會通過花粉等媒介傳播給野生物種。